Фамилия Пинежский — это чистый случай географического прозвища, перешедшего в фамилию. Её основатель получил своё семейное имя по месту жительства или происхождения: с берегов реки Пинеги или из одноимённого города Пинега (ныне посёлок в Архангельской области). Суффикс -ский в русской ономастике традиционно указывает на связь с местностью, и в XVIII–XIX веках такие фамилии часто оформлялись у выходцев из духовенства и дворянства, но могли закрепляться и за крестьянами, переселившимися в другие края.

Географическая привязка здесь абсолютно прозрачна, и это главное, что можно сказать о фамилии. Пинега — левый приток Северной Двины, а сам топоним, по наиболее принятой версии, происходит из прибалтийско-финских языков: от слова pieni — «маленький» или pien — «собака» (в значении «собачья река»). Вторая версия менее популярна, но имеет право на существование: в диалектах коми пи означает «огонь», а нег — «поток», то есть «огненный поток». Однако для носителя фамилии важнее другое: его предок почти наверняка был помором или жителем Архангельской губернии, либо его предки ушли на юг или в Сибирь, сохранив в фамилии память о родине.

Словообразовательная модель проста: основа «Пинеж-» (от прилагательного «пинежский») плюс типовой фамильный суффикс. Вариант «Пинегин» образован от той же основы, но по другой модели (с суффиксом -ин), и встречается реже. В дореволюционных переписях фамилия Пинежский встречается не только на Русском Севере, но и в Забайкалье и на Дальнем Востоке — туда ссылали или переселяли крестьян из Поморья. Таким образом, фамилия — маркер миграции: если вы носите её, ваши предки, скорее всего, покинули берега Пинеги не позднее середины XIX века.

Сословная принадлежность первых носителей неоднородна. Среди Пинежских были и священники (типичная «семинарская» фамилия для уроженцев Пинежского уезда), и государственные крестьяне. Второй вариант даже вероятнее: в духовных училищах часто давали фамилии по названиям сёл и рек, но в случае с Пинежским она могла возникнуть и стихийно — как прозвище «пинежанин» у пришлого человека. Спорных версий у фамилии нет: корень ясен, география очерчена, и это тот случай, когда этимология не оставляет места для фантазий.