Фамилия Пинусов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — «Пинус» — не встречается в современных русских именах и не связана с распространёнными прозвищами, поэтому разбор стоит начать с суффикса. Окончание «-ов» указывает на стандартную русскую патронимическую модель: так образовывали фамилии от личных имён или прозвищ, отвечая на вопрос «чей сын?». Значит, предка звали или дразнили Пинусом.

Самая правдоподобная версия ведёт к латинскому слову «pinus» — сосна. В русской ономастике известны фамилии Соснов, Соснин, а также кальки с латыни в среде духовенства. Семинаристам в XVIII–XIX веках часто давали «учёные» фамилии по названиям растений, городов или античных героев. Пинусов мог получить выпускник духовной академии или священник, которому «перевели» прозвище Сосна на латынь для благозвучия. Такая практика была распространена: отсюда же фамилии Цветков (от flos), Розов, Лилов и другие.

Есть и более прозаичный вариант: Пинус — это искажённое диалектное или заимствованное прозвище. В южнорусских говорах и украинском языке «пинус» могло означать что-то вроде «пенёк» или «чурбан» (сравните с «пень»). В таком случае фамилия указывала бы на особенность внешности или характера предка — коренастого, невысокого или упрямого человека. Третья, менее вероятная гипотеза связывает корень с греческим «пинос» (грязь, нечистота) — но для русской среды это экзотично и почти не встречается.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине, а также к регионам, где были духовные училища. В дореволюционных метрических книгах Пинусовы изредка встречаются среди мещан и крестьян Харьковской, Курской и Воронежской губерний. Это подтверждает версию о семинарском или диалектном происхождении: в центральных и северных губерниях фамилия почти не фиксируется.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает отсеять лишнее. Пинусов не стоит в одном ряду с Пинуевым или Пинухиным — там другая основа. Ближе всего к нему фамилии Пинский (от города Пинск) и Пинус (без суффикса), но последняя встречается в основном у еврейских семей как вариант фамилии Пинес. Для русских Пинусовых связь с иудейской ономастикой маловероятна: суффикс «-ов» и исторический контекст указывают на православную среду.

Коротко: предки современных Пинусовых — скорее всего, либо выходцы из духовного сословия, получившие фамилию по латинскому названию сосны, либо крестьяне с юга России, чьё прозвище Пинус (пенёк, коренастый человек) со временем закрепилось в документах. Точное значение без архивных записей не установить, но обе версии логичны и не противоречат друг другу.