Фамилия Пинютин образована от прозвища Пинюта. В основе, вероятно, лежит украинский глагол «пинити» — «мешать, препятствовать». Если так, то Пинютой могли прозвать стража: человека, который преграждал путь, стоял на заставе или не пускал чужих. Прозвище закрепилось как основное именование, а затем, по обычной славянской модели, дало фамилию: Пинюта → Пинютин, то есть «сын Пинюты». Суффикс -ин здесь указывает на принадлежность потомку, что типично для русских фамилий, образованных от личных прозвищ, оканчивающихся на -а.

Но у этой фамилии есть и другая версия, которую стоит держать в уме. В русских говорах встречается слово «пинюга» — так в некоторых регионах называли плаксу, нюню. Прозвище Пинюта вполне могло прикрепиться к человеку за обидчивость или слезливость. Эта гипотеза не менее правдоподобна, чем «страж», потому что прозвища чаще отражали характер, а не профессию. Впрочем, обе версии укладываются в логику народной этимологии, и без серьёзных генеалогических исследований сказать, какая из них верна для конкретного рода, нельзя.

Сама фамилия звучит как самобытный памятник славянской культуры, и её редкость добавляет ей ценности. Носители фамилии Пинютины встречаются в основном в центральной России и Поволжье, хотя точная география расселения рода требует отдельного изучения. Процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о времени и месте происхождения фамилии Пинютин можно лишь на основании архивных документов, ревизских сказок и метрических книг.