Фамилия Пинюта — редкий случай, когда прозвище застыло в исходной форме, без суффикса, который обычно «пришивает» фамилию к роду. Если бы перед нами был Пинютин, Пинютов или Пинюткин, всё было бы прозрачнее: перед нами типичная модель «отчество от прозвища». Но окончание -а в белорусской и украинской традиции нередко само по себе выполняет роль фамильного показателя, особенно в фамилиях на -а, -я, которые не склоняются по падежам как прилагательные. Пинюта — именно такая фамилия, и её география выдаёт западнорусские, белорусские и украинские корни.

Основа фамилии — прозвище Пинюта. В говорах северо-запада и запада России, а также в белорусском языке «пинюга», «пиня» означало нечто маленькое, невзрачное, либо человека медлительного, квелого. Есть и другая версия: «пинять» в некоторых диалектах — «жаловаться», «ныть», «пилить». Прозвище Пинюта могли дать ворчливому или плаксивому человеку, тому, кто постоянно «пинял» — то есть придирался или ныл. Третья, менее вероятная, но упоминаемая в ономастике версия — связь с польским или литовским корнем, где «pieniać» означало «менять», «обменивать», но для фамилии Пинюта эта гипотеза слабая и не находит подтверждения в массовых данных.

В писцовых книгах и ревизских сказках XVII–XVIII веков фамилия Пинюта встречается в основном на территории современной Витебской, Могилёвской и Смоленской областей. Это регионы, где активно шло смешение белорусских и великорусских говоров, а суффикс -ута (-юта) характерен для прозвищной модели (сравните: Кривута, Хилюта, Лепета). Социально носители фамилии относились по большей части к крестьянству или однодворцам — то есть к свободным, но не дворянским слоям.

С точки зрения словообразования, Пинюта — пример так называемой «прозвищной фамилии без оформления», когда исходное уличное имя стало родовым без добавления патронимического суффикса. В русской традиции это редкость, в украинской и белорусской — норма. Поэтому если вы встретили Пинюту в современной России, скорее всего, его предки пришли с запада или юго-запада, где такие фамилии не переделывали под стандартную модель на -ов.

Однокоренные фамилии — Пинютин, Пинюгов, Пиняев, Пинягин — распространены шире, но все они восходят к той же основе: прозвищу от глагола «пинять» или существительного «пиня». Пинюта стоит особняком, сохранив архаичную форму, по которой можно судить о том, как в XVII веке фиксировали человека по уличному имени: без лишних суффиксов, коротко и ёмко.