Фамилия Панюта представляет собой застывшую форму имени Панюта — производной формы имени Павел, которое в переводе с латинского означает «маленький». Также не исключено, что имя Панюта является производной формой имени Пантелеймон (от греческого «всемилостивый»), Панкрат (от греческого «всемогущий») или Панфил (от греческого «всеми любимый»).