Фамилия Пирдунова — женская форма фамилии Пирдунов, и её происхождение сразу упирается в основу «пирд-», которая в русском языке звучит неблагозвучно и вызывает ассоциации с просторечной лексикой. Однако в ономастике прямой путь не всегда верен. Скорее всего, корень здесь — не обсценный, а диалектный или искажённый.

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища Пирдун, которое могло возникнуть от глагола «пирдеть» в некоторых южнорусских и украинских говорах — «сильно пыхтеть, кряхтеть» или «издавать глухой звук». Такое прозвище могли дать человеку медлительному, тяжелому на подъём или тому, кто при работе издавал характерные звуки (например, кузнецу, дровосеку). Модель образования типична: основа глагола + суффикс -ун (как в словах «бегун», «крикун»), а затем стандартный патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность к роду Пирдуна.

Менее распространенная, но возможная версия — связь с диалектным словом «пирд» в значении «прыщ, волдырь» или «комок грязи». Тогда Пирдун — человек с нечистой кожей или неряшливый. В любом случае, фамилия относится к разряду «говорящих» прозвищ, которые фиксировали внешние или поведенческие черты, а не профессию.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, Пирдуновы сосредоточены в основном в Центральной России и Поволжье, но точной региональной привязки нет. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не фиксировалась из-за неблагозвучия: многие носители могли сменить её на более благопристойный вариант (например, Пердунов, Пирогов) или упростить написание. Социальный состав — скорее крестьянское или мещанское сословие, без дворянских корней.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Пердунов, Пырдунов, Пирдюк) подтверждает, что основа устойчива, но вариативна из-за аканья или местных говоров. Пирдунова — не случайное искажение, а закономерная форма, сохранившая редкое прозвище, которое сегодня кажется грубым, но в прошлом было обыденным бытовым именованием.