Фамилия Пискотин — редкий случай, когда угадывается основа, но споры о её значении неизбежны. По модели образования это типичная русская фамилия на -ин, то есть притяжательное прилагательное, отвечавшее на вопрос «чей?». Основа — прозвище или нецерковное имя Пискота, которое и дало фамилию.

Самая прямая версия отсылает к глаголу «пискать». Пискотней в старых говорах называли не только писк, но и пустые разговоры, ворчание или плаксивость. Прозвище Пискота могли дать ребёнку, который много плакал, или взрослому — занудливому, постоянно жалующемуся человеку. В этом случае фамилия относится к группе «характерологических» — описывающих поведение, как Плаксин, Крикунов или Ворчун.

Менее очевидная, но более интересная версия — связь с диалектным словом «пискотина», которое в некоторых областях (например, в архангельских говорах) означало мелкую рыбёшку, малька. Тогда прозвище могло закрепиться за рыбаком, которому попадалась только мелочь, или за человеком маленького роста, щуплого телосложения. Эта версия объясняет, почему в основе не глагол, а существительное с суффиксом -от-/-ет- (как «быстрота» или «теснота»), которое потом сократилось до прозвища.

География фамилии подсказывает, что она не массовая. Пискотины встречаются в основном в центральных областях России и в Поволжье, с небольшим числом записей в старых переписях. Это не дворянский род и не фамилия, попавшая в «Бархатную книгу» — скорее, крестьянское или мещанское прозвание, которое закрепилось за одной-двумя семьями и не получило широкого распространения.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в одном ряду с Пискуновым, Пищалиным, Пискловым — все от звукоподражательной основы «писк-». Но суффикс -от-/-ет- делает Пискотина более редкой: таких фамилий, как Скрипотнин или Сопотнин, почти нет. Это и есть та уникальная черта, которая выделяет фамилию на фоне однокоренных — необычная морфология прозвища, от которого она образована.