Фамилия Подчинёнова хранит в своей основе прозвище Подчинённый, которое, в свою очередь, восходит к слову «подчинение». Вероятно, так в старину называли человека, находившегося на службе, в подчинении у кого-либо, или же просто служивого. Это типичное «профессиональное» именование, указывающее на род деятельности или положение человека в обществе. Можно предположить, что основатель рода не занимал руководящих должностей, а его место в служебной иерархии было подчинённым, что и закрепилось в прозвище.

Сама модель образования фамилии проста и характерна для русского ономастикона: от прозвища на -ый (Подчинённый) через притяжательный суффикс -ов- возникла форма Подчинёнов, а женский вариант Подчинёнова — это уже указание на принадлежность к роду. Интересно, что ударение в фамилии падает на ё, что сохраняет связь с исходным прилагательным и отличает её от возможных вариантов с иным произношением.

Стоит заметить, что прозвище Подчинённый могло закрепиться не только за служивым человеком. В крестьянской среде так могли назвать работника, батрака, который находился в зависимости от хозяина. В любом случае, прозвище отражало социальный статус предка, а потому фамилия Подчинёнова — это не просто набор букв, а сжатый документ о положении человека в обществе несколько веков назад.

Родственные фамилии — Подчинёнов, Подчинённый, Подчиненко — встречаются в разных регионах России и Украины, что говорит о широком бытовании этого прозвища в народной среде. Потомок человека, которого звали Подчинённый, со временем получил фамилию Подчинёнов, и она передавалась из поколения в поколение, сохраняя память о своём первоносителе.