Фамилия Поджунас образована от аналогичного прозвища, которое восходит к латышскому прилагательному podzhunis, что в переводе на русский язык означает «проворный, бойкий, резвый». Вероятно, прозвищем Поджунас нарекали ловкого, умелого, быстрого, прыткого человека. Таким образом, это прозвище указывало на черты характера и поведение основателя рода Поджунас.