Фамилия Поджун — редкая и неоднозначная по происхождению. В ней слышится что-то нерусское, и это не случайно. Первое, что бросается в глаза: отсутствие типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский). Это намекает на то, что фамилия могла быть заимствована или образована не по славянской модели, а пришла из другого языка в уже готовом виде.

Самая вероятная версия — южнославянские или западнославянские корни. В польском, чешском, словенском или хорватском языках слово «podżun» или «podžun» могло быть прозвищем. Разбираем по частям: «pod» означает «под», а «žun» — устаревшее или диалектное слово, обозначающее «долг», «обязанность» или «аренда». В средневековой Польше «żun» — это вид поземельной платы, оброка. Соответственно, «podżun» — человек, который находился под оброком, то есть зависимый крестьянин, арендатор, обязанный выплачивать подать. Прозвище могло закрепиться за тем, кто долго не мог выплатить долг, или за управляющим сбором этой платы.

Менее популярная версия связывает фамилию с итальянским или французским «pigion» (голубь), но тогда форма должна была бы быть «Поджион» или «Пижон». Для русского уха «Поджун» звучит как нечто «жужжащее» или «гудящее», но это случайное созвучие. Версия с тюркским корнем (например, «джун» — шерсть, руно) маловероятна: приставка «под» — славянская, и такое смешение языков в одной фамилии встречается крайне редко.

Географически фамилия Поджун в России встречается точечно, чаще всего в Краснодарском крае и Ростовской области — регионах, куда в XIX–XX веках переселялись южные славяне (сербы, болгары, хорваты). Носители могли быть потомками переселенцев, которые русифицировали написание, но сохранили исходную основу.

С точки зрения словообразования, это типичная «прозвищная» фамилия, застывшая без суффикса. В славянской традиции так часто называли людей по социальному статусу или роду занятий: Поджун — «тот, кто под оброком». Аналог по смыслу — русские фамилии Оброчный, Оброков, Даньщиков, но Поджун звучит архаичнее и явно пришло из другого диалекта.