Фамилия Полубкова — женская форма, мужская — Полубков. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Полубок. Разобрать его можно двояко, и обе версии имеют под собой почву.

Первая, самая прямая: «полу-» означает «наполовину», а «бок» — часть тела. Полубок — человек, лишившийся половины бока, например, из-за ранения или болезни. В крестьянской среде такие прозвища давали без злого умысла, по заметной внешней примете. Вторая версия опирается на диалектное слово «полубок» — так в некоторых говорах называли косой, скошенный предмет или что-то, стоящее на боку. Тогда прозвище могло закрепиться за человеком с кривой осанкой или хромотой, из-за которой он клонился на один бок.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов (в женском роде -ова) присоединился к основе Полубок. Такие фамилии обычно означали принадлежность: «чей?» — Полубков, то есть сын Полубка. Суффикс -к- в основе указывает, что прозвище, скорее всего, было уменьшительным или обиходным, а не грубым.

Фамилия редкая. Встречается в центральных и северных областях России, но без выраженного гнезда. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских с фамилией Полубков, но массового распространения она не получила. Среди известных носителей нет громких исторических фигур — фамилия осталась в кругу простонародья.

Если сравнивать с однокоренными, то Полубков стоит в одном ряду с Полубояриновым, Полуэктовым или Полуниным — все они образованы от имён и прозвищ с приставкой «полу-». Но в отличие от них, где вторая часть означала социальный статус или имя, Полубков упирается в бытовую, телесную примету. Это делает её более «земной» и конкретной, без налёта условности.