Фамилия Помутко — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание необычным звучанием. Её основа, судя по всему, связана с глаголом «мутить» или прилагательным «мутный». В русских говорах «помутка» могло означать не только помутнение рассудка, но и, например, внезапную перемену погоды, ссору или неясное дело. Однако вряд ли предок получил прозвище за то, что был «мутным» человеком. Скорее всего, прозвище Помуток (от которого и пошла фамилия) давали человеку деятельному, но неспокойному — зачинщику ссор, баламуту, или же тому, кто работал с жидкостями, например, на мельнице или в красильне, где постоянно «мутят» воду.

Суффикс -ко — характерный украинский или белорусский. Фамилии на -ко (Помутко, Мутко, Шумейко) в большинстве своём происходят из западнорусских земель, особенно с территории современной Украины и Беларуси. Модель образования простая: прозвище Помуток (или Помут) + уменьшительно-ласкательный суффикс -ко, который в восточнославянской ономастике часто закреплялся как фамилия без дополнительных окончаний. Таким образом, Помутко — это «сын Помутка» или просто «маленький Помуток», но со временем прозвище стало наследственным.

Интересная деталь: фамилия Помутко встречается очень редко. Она не входит в списки массовых русских фамилий, и её носители, скорее всего, имеют корни в одном из регионов Черниговщины, Полтавщины или Гомельщины. Есть и альтернативная версия, которую выдвигают некоторые ономасты: основа могла быть заимствована из тюркских языков, где «мут» означает «сильный», «крепкий». Но эта гипотеза слабая, так как суффикс -ко однозначно указывает на славянскую, а не тюркскую среду образования фамилии.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Помутко стоит особняком. Есть Мутко (более известная, но тоже редкая), Мутовкин (от «мутовка» — кухонная утварь), Мутных (северорусская форма). Помутко же — единственная, где приставка «по-» добавляет оттенок завершённости действия: «тот, кто помутил». Это могло быть прозвище человека, который однажды сильно всех перессорил или, наоборот, «замутил» какое-то дело, после чего прозвище прилипло навсегда. Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане.