Фамилия Поноянов — одна из тех, где корень неочевиден и требует разбора по частям. В ней сочетаются суффикс -ов, указывающий на принадлежность (чей? — сын Понояна), и основа, которая сама по себе является производной. Модель образования здесь типична для русских фамилий, но исходное прозвище или имя — редкое.

Наиболее правдоподобная версия связывает основу «Поноян» с диалектным или профессиональным словом. В некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, «поной» или «поноя» могло означать человека, который постоянно ноет, жалуется, канючит. Глагол «поноять» — докучать, надоедать просьбами. В таком случае прозвище Поноян давали не в обиду, а как бытовую характеристику: ворчливый, нудный, или, наоборот, настойчивый до назойливости. Суффикс -ян здесь — не фамильный, а часть самого прозвища, уменьшительная или пренебрежительная форма (как, например, «гулян» от «гулять»). Фамилия Поноянов, таким образом, означает «сын Понояна», то есть потомок человека с таким прозвищем.

Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит имя или прозвище, связанное с рекой Поной на Кольском полуострове. В этом случае Понояном могли прозвать выходца с берегов Поноя — поморского села или самого водоема. Однако такая версия слабее, потому что топонимические фамилии чаще образуются напрямую через суффикс -ский (Поно́йский), а не через личное прозвище Поноян.

Суффикс -ов в конце — стандартный русский патроним, закрепившийся за фамилией. Это значит, что род, скорее всего, крестьянский или мещанский, без дворянских приставок. Фамилия редкая, её географию можно связать с северными и центральными областями России, где бытовали соответствующие диалекты. Никаких известных исторических деятелей или знаменитых носителей с такой фамилией не зафиксировано — это типичная «деревенская» фамилия, возникшая из прозвища, которое в XXI веке уже почти забыто.