Фамилия Попочкина — женская форма фамилии Попочкин, которая образована от прозвища или нецерковного имени Попочка. Основа здесь прозрачна: «поп» — священник, а уменьшительный суффикс -очк- придаёт слову ласкательный или, возможно, ироничный оттенок. В русских говорах «попочкой» могли назвать маленького сына священника, молодого попа, а то и просто бойкого, себе на уме человека — не обязательно связанного с церковью. Такие прозвища давали по сходству поведения или внешности: суетливый, важный, либо, напротив, хитрый и юркий.

Модель образования типична для русских фамилий на -ин: суффикс принадлежности указывает на родство — «чей?» — попочкин, то есть сын или потомок Попочки. Женская форма Попочкина закрепилась в документах как вариант для замужних женщин или дочерей, но в современном употреблении она чаще всего просто фамилия по мужу или отцу, без привязки к полу носителя в прошлом.

Фамилия редкая, нечастотная. Встречается в центральных регионах России, в частности в бывшей Вятской губернии и в Поволжье — там, где были густые сети сельских приходов и где прозвища от «поп» давали особенно охотно. В отличие от массовых Поповых (самой распространённой русской фамилии), Попочкины — вариант с уменьшительным суффиксом, что указывает на конкретное прозвище родоначальника, а не на общую принадлежность к сословию священнослужителей. Версия, что фамилия могла возникнуть от украинского или белорусского «попочка» (маленький поп), тоже возможна, но менее вероятна: суффикс -очк- скорее великорусский, чем южнорусский.

В дореволюционных переписях Попочкины фигурируют как крестьяне и мещане, реже — как купцы. Священников среди них почти нет: фамилия чаще всего была мирской, а не церковной. Таким образом, предки носительницы фамилии, скорее всего, не служили в храме, а получили прозвище по какой-то бытовой черте — ироничное «попёнок» или «попочка» закрепилось за родом и перешло в фамилию.