Фамилия Поповкина образована от прозвища Поповка. В его основе лежит нарицательное «поповка», которое имеет значение «круглое броненосное судно, построено по системе вице-адмирала Попова» («Толковый словарь живого великорусского языка» В.И. Вполне возможно, что прозвище Поповка мог получить человек, который занимался судостроительством. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Поповка, со временем получил фамилию Поповкина.