Фамилия Пойгонков восходит к прозвищу Пойгонок, которое, скорее всего, образовано от основы «пойг» с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса -онок. Согласно одной из версий, это прозвище происходит от слова «пойга», которое в «Толковом словаре живого великорусского языка» В.И. Даля трактуется как «мальчик, мальчишка». Следует отметить, что это слово было заимствовано из карельского языка, где роigа означает «мальчик, детеныш». Вполне вероятно, что прозвище Пойгонок являлось внутрисемейным: так родители могли называть долгожданного сына. Не исключено также, что прозвище Пойгонок имеет тюркское происхождение и ведет свое начало от слова «пойга» - «народная игра, состязание в беге, скачки». В таком случае основатель рода Пойгонковых, возможно, любил участвовать в этой игре. Кроме того, существует версия, что прозвище Пойгонок этимологически связано с мокшанским словом «пайге», которое переводится как «колокол». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности человека: предок современного носителя фамилии Пойгонков мог быть звонарем. Фамилия Пойгонков встречается крайне редко. В исторических документах упоминается участник Великой Отечественной войны Егор Александрович Пойгонков, родившийся в деревне Застолбье Тверской области. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пойгонок, со временем получил фамилию Пойгонков.