Фамилия Пойгин образована от прозвища Пойга. Оно, в свою очередь, происходит от диалектного слова «пойга», которое в архангельских и тверских говорах означает «мальчик». Скорее всего, прозвище Пойга родители могли дать единственному в семье ребенку мужского пола. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пойга, со временем получил фамилию Пойгин.