Фамилия Пранкратов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, искажённое церковное слово. Самая правдоподобная версия выводит её из греческого «панкратион» (πανκράτιον) — вид спортивного единоборства в античных Олимпийских играх, что в переводе означает «всеборье» или «всесилие». В православной традиции это слово дало имя Панкратий (Панкрат). В народном произношении, особенно в северных и сибирских говорах, начальное «Пан-» нередко переходило в «Пран-»: Панкрат превращался в Пранкрата, а затем и в фамилию Пранкратов.

Суффикс «-ов» в финале указывает на стандартную русскую патронимическую модель XIX века: Пранкратов — буквально «сын Пранкрата». То есть предок носителя фамилии носил редкое каноническое имя Панкратий (в просторечии Панкрат, Пранкрат). Имя это было распространено среди духовенства и крестьян, но никогда не входило в число самых частых, поэтому и фамилия осталась штучной, нетиражированной.

Есть и менее очевидный вариант: связь с диалектным глаголом «пранкать» (бить, колотить, стучать) или «пранка» (плеть, кнут). В таком случае Пранкратов могло быть прозвищем человека с резким, «бьющим» характером или того, кто работал с кнутом — погонщика, ямщика. Но эта гипотеза слабее: во-первых, глагол редок и локален, во-вторых, для фамилии на «-ов» естественнее имя, а не прозвище на «-ат».

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку — Вологодская, Архангельская, Вятская губернии. В метрических книгах XIX века Пранкратовы встречаются преимущественно среди государственных крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современных телефонных справочниках она остаётся редкой: на всю Россию — не более пары сотен носителей, в основном в Кировской области и Пермском крае.

Написание с двумя «р» (Пранкратов, а не Панкратов) — устойчивая особенность, закрепившаяся в документах. Она помогает отличить фамилию от более распространённой Панкратов, хотя корень у них один. Если ваш предок писался через «а», а не «о» (Пронкратов), это, скорее всего, описка писаря или влияние местного окающего говора.