Фамилия Пренковат — редкий случай в русской ономастике. В ней нет привычных для восточнославянских фамилий суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -ат сразу выдает нерусское происхождение, и здесь возможны два основных пути: южнославянский (сербский, болгарский) или румынский/молдавский.

Первое, что приходит в голову лингвисту, — основа «пренк-». В сербском и болгарском языках есть глагол «пренути» — «встрепенуться», «вздрогнуть», «проснуться». От него образовано прилагательное «пренковат» — «вздрагивающий», «нервный», «взбалмошный». В южнославянской традиции такие прозвища давали человеку с живым, порывистым характером. Суффикс -овит/-оват в сербском часто переходит в -ат при адаптации в русском языке, поэтому Пренковат могло быть исходным прозвищем, которое закрепилось как фамилия.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: румынское происхождение. В румынском есть слово «prunc» — «младенец», «ребенок». Форма «pruncovat» могла означать «детный», «плодовитый». Однако в молдавских и румынских фамилиях чаще встречаются окончания -еску, -ан, а не -ат, поэтому эта гипотеза слабее.

Географически фамилия Пренковат встречается в основном на юге России и в украинском Причерноморье — зонах, куда в XIX веке переселялись сербы и болгары. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были выходцами с Балкан, получившими прозвище за манеру поведения. Никакого дворянского или купеческого следа за фамилией не зафиксировано, она остается простонародной, прозвищной по происхождению.