Фамилия Прогогин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов или -ин, который сразу указывает на отчество или принадлежность. Основа «Прогог» звучит не по-русски, и это ключ к разгадке.

Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или мирского имени, которое имеет тюркские или монгольские корни. В тюркских языках есть слово «прог» (или близкое к нему), означающее «сила», «мощь», «крепость». В этом случае Прогогин — это «сын Прогога», то есть потомок человека, которого прозвали Сильным или Мощным. Суффикс -ин здесь работает по той же модели, что и в фамилиях Пушкин (от Пушка) или Ильин (от Илья): он указывает на принадлежность к роду человека с таким прозвищем.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — связь с греческим именем Прокопий (в просторечии Прокофий или Прокоп). В некоторых говорах имя могло сократиться до формы «Прог» или «Прога», а затем через суффикс -огин дать фамилию Прогогин. Однако эта гипотеза слабее: для русского уха естественнее было бы превратить Прокопия в Прокопьева или Прокофьева, а не в Прогогина.

География фамилии сегодня невелика. Прогогины встречаются единично, в основном в центральной России и Поволжье — регионах, где исторически было сильное тюркское влияние. Это косвенно подтверждает первую, тюркскую, версию.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна: суффикс -ин присоединён к основе, которая сама по себе не является распространённым русским словом. Это делает фамилию Прогогин уникальным маркером происхождения от конкретного прозвища, а не от массового имени или профессии.