Фамилия Прокнерс — редкий пример того, как фамилия переезжает через границы и меняет облик. Перед нами, скорее всего, литовская адаптация немецкой фамилии Прокнер, где конечное -с добавлено по законам литовской грамматики для обозначения мужского рода. Такой путь прошли многие фамилии на территории бывшей Восточной Пруссии и Литвы, где немецкое и балтское население жило вперемешку.

Сама немецкая основа Прокнер — это прозвище, и здесь есть две главные версии. Первая ведет к нижненемецкому слову prēn, что значит «шило сапожника». Тогда Прокнер — это сапожник, точнее, человек, чье ремесло было связано с этим инструментом. Прозвища по профессии — самый частый источник фамилий, поэтому эта версия выглядит правдоподобно: предок мог быть мастером по пошиву или ремонту обуви.

Вторая версия связывает фамилию с немецким словом Brake — «подлесок, молодая поросль», «невспаханная земля» или «целина». В таком случае Прокнер — это человек, живший рядом с рощей или на расчищенном участке. Подкрепляет эту гипотезу и топонимика: город Брак в Германии существует, и выходец оттуда вполне мог получить прозвище по месту рождения. Обе версии имеют право на жизнь, но первая, ремесленная, кажется более конкретной и потому более вероятной: прозвища по инструменту и занятию давали чаще, чем по ландшафту.

Важно понимать, что фамилия Прокнерс — не русская и не славянская. Ее появление в русскоязычной среде — следствие миграций и смешения культур. Носители такой фамилии почти наверняка имеют предков из Прибалтики или из немецких колоний, которые в разное время оказывались на территории Литвы и соседних земель.