Фамилия Прожегес — редкая, и её происхождение неочевидно для русского уха. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на позднее, часто искусственное или иноязычное происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от латинского слова projicio, projicere — бросать, метать, выбрасывать. В таком случае Прожегес — это русифицированная форма латинского причастия или существительного, означающего «метатель», «бросающий». Такие фамилии в России могли давать выпускникам духовных семинарий, где латынь была основным языком обучения. Семинаристы получали фамилии по переводу своих русских прозвищ на латынь или по торжественным понятиям. Русское прозвище «Метатель» или «Бросающий» могло превратиться в Прожегес.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — искажённая запись фамилии из западноевропейских языков, например, польского или немецкого. В польском есть слово prożeg — пастбище, выгон, или prożegać — просить, молить. Однако фонетика фамилии (ударение, скорее всего, на второй слог: Проже́гес) тяготеет к латинскому образцу. Если бы корень был славянским, мы бы ожидали суффиксального оформления: Прожега, Прожегов, Прожегин.

География фамилии неширокая. Носители встречаются в основном на юге России и Украине, в бывших казачьих областях, а также среди потомков духовенства. Социальный контекст: если фамилия семинарская, то предок был человеком грамотным, книжным, возможно, учителем или священником. Если же это искажённая запись польской фамилии (например, Пшежег или Пшежес), то предки могли быть выходцами из Речи Посполитой, осевшими в Малороссии.

Словообразовательная модель здесь уникальна для русской ономастики: основа-корень без суффикса, что нетипично. Это делает фамилию Прожегес «говорящей» для тех, кто знаком с латынью, и загадочной для всех остальных. Споров о корне почти нет: основная гипотеза — латинская, и она же самая правдоподобная.