Фамилия Прядухин — одна из тех, что сразу выдают род занятий предка. В её основе лежит глагол «прясть» — то есть вить нить из кудели, превращать пучок волокна в длинную прочную нитку. Прядуном, прядухой или прядухой на Руси называли того, кто занимался прядением. Но здесь есть тонкость: суффикс -ух- в русских фамилиях чаще указывает не на профессиональное название, а на прозвище по действию. Прядуха — это не просто «пряха», а человек, который всё время прядёт, возможно, даже слишком усердно или, наоборот, медленно и нудно. Такие прозвища давали по заметной черте поведения или привычке.

Словообразовательная модель Прядухин — типичная для русских фамилий на -ин. Суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на -а или -я: Прядуха → Прядухин. Это значит, что фамилия образована от прозвища в женском роде. В крестьянской среде прядение было почти исключительно женским занятием, но прозвище «Прядуха» могли дать и мужчине — либо в насмешку за то, что он выполнял женскую работу, либо за его манеру говорить или двигаться, напоминающую монотонные движения пряхи. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные образования (от глагольных основ с суффиксом -ух-) отнесены к разряду прозвищных, а не профессиональных.

Географически фамилия Прядухин встречается в основном в центральных и северных областях России, где прядение было особенно развито. В Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях — в зоне традиционного льноводства — такая фамилия могла возникнуть естественно. Интересно, что в некоторых говорах «прядуха» означала не только прядильщицу, но и особую прялку с большим колесом, а также время года, когда садились прясть — «прядуха» как осенне-зимний период женских работ. Возможно, прозвище закрепилось за человеком, родившимся или особенно активным в это время.

В отличие от более распространённых фамилий Пряхин, Прялкин, Прядкин, вариант Прядухин сохранил редкий суффикс, который в современном языке почти не используется для образования новых прозвищ. Это делает фамилию ценной для историков языка: она зафиксировала живую разговорную форму XVII–XVIII веков, когда суффикс -ух- был продуктивным и мог обозначать как лицо, так и предмет. Прядухины, скорее всего, не были помещиками или служилыми людьми — фамилия осталась в крестьянской среде, и её носители до отмены крепостного права чаще всего числились среди государственных или помещичьих крестьян северных и центральных губерний.