Фамилия Пугусова — женская форма фамилии Пугусов, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени, которое легло в основу мужского варианта. Слово «пугус» в русских говорах не встречается как общеупотребительное, что указывает на возможное иноязычное или диалектное происхождение. Наиболее вероятная версия — связь с тюркскими языками, где корень «пуг» или «буг» мог означать «бык» или «силач», а суффикс «-ус» — уменьшительную или прозвищную форму. В таком случае Пугус — это прозвище крепкого, упрямого человека, которое затем закрепилось как фамилия.

Суффикс «-ов» в фамилии Пугусов указывает на типичную русскую модель образования от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный. Такая модель была распространена в XVI–XVII веках среди крестьян и посадских людей, когда фамилии фиксировались по отцу: «чей сын?» — Пугусов. Географически фамилия редкая, и её следы можно найти в документах по южным и восточным регионам России, где было сильное тюркское влияние — например, в бывшей Казанской или Оренбургской губерниях. Это подтверждается тем, что подобные фамилии (Пугаев, Пугин, Пугачёв) часто имеют тюркские корни.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с финно-угорскими языками. В коми-пермяцком языке есть слово «пуг» — «гриб», но суффикс «-ус» для него нетипичен. Если допустить, что прозвище Пугус дали человеку, собиравшему грибы или жившему в лесистой местности, то фамилия могла возникнуть на севере или Урале. Однако эта гипотеза слабее, так как в русских говорах «пугус» не фиксируется как диалектное слово, а тюркская версия подкрепляется целым пластом аналогичных фамилий.

Социально носители фамилии Пугусовы, скорее всего, были крестьянами или однодворцами, так как фамилии с такой словообразовательной моделью редко встречаются у дворянства. В XIX веке фамилия могла писаться через «о» или «а» в окончании (Пугусова — женская форма), но в метрических книгах варианты с «ы» (Пугусовы) тоже возможны. Сегодня Пугусова — редкая фамилия, и её носители, вероятно, сосредоточены в нескольких регионах, что делает её интересным объектом для семейного поиска.