Фамилия Пужайкин образована от прозвища Пужайко. Видимо, предок, его получивший, обладал такими чертами характера, как пугливость, немотивированная боязнь чего бы то ни было. Суффикс –КО может указывать на белорусское происхождение прозвища. В результате, потомки человека, обладающего прозвищем Пужайко, со временем получили фамилию Пужайкин.