Фамилия Пуженкова — женская форма мужской фамилии Пуженков, которая образовалась от прозвища или имени Пуженок. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать словообразовательную цепочку. Суффикс -ов-/-ев- указывает на принадлежность: Пуженков буквально означало «сын Пуженка» или «человек из семьи Пуженка». А сам Пуженок — это уменьшительно-ласкательная форма от прозвища Пуженя или Пужень.

Основа «пуж-» в русских говорах связана с глаголом «пужать» (пугать). В диалектах «пужа» или «пужня» — это нечто пугающее, страшилище, а также человек, который любит пугать или сам всего боится. В ономастике такое прозвище могли дать либо пугливому, робкому человеку, либо, наоборот, тому, кто наводил страх на других. Учитывая, что уменьшительный суффикс -енок часто использовался для детей и молодых людей, Пуженком, скорее всего, называли боязливого мальчика или подростка.

Встречается и другая версия, менее вероятная, но не исключённая: корень «пуж-» мог быть связан с диалектным словом «пужа» — шишка, нарост (например, на дереве). В этом случае прозвище давалось по внешнему признаку. Однако для фамилий, образованных от глагольных основ, первое значение (пугать) встречается чаще и лучше подтверждается историческими источниками, в том числе данными словаря русских фамилий Б. Унбегауна.

Географически фамилия Пуженков (и Пуженкова) тяготеет к северным и центральным регионам России, особенно к Вологодской, Архангельской и Костромской областям. Там диалектное «пужать» было в ходу, и прозвища на -енок встречаются чаще, чем в южных говорах. Это указывает на то, что предки носительниц фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми Русского Севера.

Интересная особенность: фамилия Пуженкова — сравнительно редкая, она не попала в списки массовых дворянских фамилий и не получила широкого распространения за счёт переселений. Это значит, что большинство современных Пуженковых могут быть дальними родственниками, происходящими из одного или нескольких близких сёл. В написании встречаются варианты с одной «н» (Пуженкова) и с двумя (Пуженникова) — последний случай указывает на другую словообразовательную модель (суффикс -ник-), но корень остаётся тем же.