Фамилия Пыдер образована от мирского имени Пыдер, которое восходит к эстонскому существительному põder в значении «лось». Вероятно, имя Пыдер имело охранительное значение. Давая младенцу такое имя, как Пыдер, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделен лось.