Фамилия Пыпыка — редкий случай, когда основа слова не имеет очевидных параллелей в современном русском языке, и это сразу задаёт направление поиска. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ык-. В русских фамилиях он встречается нечасто и обычно указывает на украинское или белорусское происхождение (сравните: Ковалык, Бондык). В сочетании с окончанием -а (характерным для украинских фамилий) это почти наверняка говорит о том, что фамилия сформировалась на территории современной Украины или юго-западных областей России.

Корень «пып-» — самый загадочный. В русских говорах слова «пыпыка» нет, но есть диалектное «пыпать» — в некоторых регионах так говорят о быстром, суетливом движении, о возне. Возможно, прозвище Пыпыка дали человеку непоседливому, «ёршику», который постоянно суетится. Есть и более прозаичная версия: в украинских говорах «пипка» (с твёрдым «ы» на месте «и») — это трубочка, мундштук, а в переносном смысле — маленький, незначительный человек. Фонетический переход «пип» → «пып» не редкость для некоторых южнорусских и украинских диалектов, где «и» произносится ближе к «ы».

Третья, менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с тюркскими языками. В крымскотатарском, например, есть слово «pıpı» — цыплёнок, птенец. Если предки Пыпыки жили на южных рубежах, где контактировали с тюркским населением, такое прозвище могло закрепиться как ласковое или ироничное обращение к младшему члену семьи. Однако в пользу славянской версии говорит именно суффикс -ык-, который в тюркских фамилиях почти не встречается.

Сословная принадлежность носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или казачьей. Фамилии на -ык/-ик в малороссийской среде часто давали рядовым общинникам, без привязки к дворянству. В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия Пыпыка встречается единично, в основном в центральных и южных областях Украины, что подтверждает её региональную привязку.

Таким образом, фамилия Пыпыка — это прозвищное имя, скорее всего, украинского происхождения, образованное от диалектного слова, характеризующего человека по поведению (суетливый) или по внешнему признаку (малорослый). Редкость фамилии делает её ценным маркером локальной истории — она могла возникнуть и закрепиться в одном-двух сёлах, не получив широкого распространения.