Фамилия Раганьян — редкий для русского уха случай, где сразу бросается в глаза суффикс -ян. В русской ономастике этот суффикс — верный маркер армянского происхождения. Если разобрать фамилию по модели, то она образована от основы «Раган» (или «Рагань») с помощью патронимического суффикса -ян, который в армянском языке означает «принадлежащий к роду» или «потомок». Таким образом, Раганьян — это потомок человека по имени или прозвищу Раган.

Корень «Раган» не имеет однозначного толкования, и здесь начинается самое интересное. В армянском языке слово «раган» (ռագան) не является широкоупотребительным, поэтому, скорее всего, основа — это диалектное прозвище или адаптация иноязычного слова. Одна из версий связывает её с персидским или тюркским корнем, где «раган» могло означать «краска», «цвет» или «жир», «масло» (сравните с тюркским «раган» — масло, жир). В таком случае прозвище Раган могли дать человеку, связанному с производством красок, торговлей маслом или имевшему смуглый, «маслянистый» цвет кожи.

Другая версия, более правдоподобная для армянской среды, — топонимическая. В Армении и исторической Западной Армении встречаются населённые пункты с похожими названиями, например, село Раган (или Рагана). Тогда фамилия Раганьян указывает на выходца из этого места. Учитывая, что многие армянские фамилии образованы именно от названий сёл и городов, этот вариант выглядит естественным: переселенец из села Раган становился Раганьяном.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для армянских фамилий конца XIX — начала XX века, когда массово закреплялись фамилии с суффиксом -ян. До этого армяне часто обходились именем и указанием на отца или место рождения. Фамилия Раганьян — не аристократическая (у армянской знати чаще встречались суффиксы -уни, -енц), а народная, крестьянская или ремесленная. Встретить её можно среди потомков армян, переселившихся в Россию после геноцида 1915 года или в ходе более поздних миграций. Сейчас это редкая фамилия, носители которой живут в основном в России, Армении и странах армянской диаспоры.