Фамилия Рагозинников — один из тех случаев, когда суффикс говорит о происхождении больше, чем корень. Модель образования здесь двойная: сначала от прозвища или имени Рагоза образовали отчество Рагозин (чей сын?), а затем к нему добавили ещё один патронимический суффикс -ник, превратив фамилию в Рагозинников. Такая конструкция характерна для северных и центральных губерний России, где в XVII–XVIII веках фамилии нередко «наращивали» дополнительными суффиксами, чтобы отличать односельчан с одинаковым отчеством. В итоге получилась фамилия, которая буквально значит «внук Рагозы» или «потомок Рагозина».

Корень «рагоз-» в русских говорах имел два основных значения. Первое — «ссора, брань, перебранка» (отсюда глагол «рагозиться» — браниться, скандалить). Второе, менее известное — «непоседа, егоза, беспокойный человек». В некоторых диалектах так называли и болтуна, пустомелю. Поэтому прозвище Рагоза мог получить человек сварливый, неуживчивый или, наоборот, слишком суетливый и непоседливый. Встречается и мирское имя Рагоза — его давали в семье как оберег: считалось, что имя с негативным оттенком отпугнёт злых духов.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» есть несколько фамилий на -озинников (например, Бороздинников, Колозинников), что подтверждает: модель не единичная, но редкая. Встретить Рагозинникова можно было в основном в Вологодской, Архангельской и Пермской губерниях — там, где суффикс -ник активно использовали для образования фамилий от отчеств и прозвищ. В переписях XIX века фамилия фиксируется в основном у государственных крестьян, реже — у мещан. Дворянских родов с такой фамилией не обнаружено.

Любопытно, что фамилия могла писаться и через одно «н» — Рагозиников. В документах XVIII века встречаются оба варианта, хотя более последовательным с точки зрения словообразования выглядит именно двойное «н»: от Рагозин (чей?) → Рагозинников (чей внук?). Со временем написание стабилизировалось, но в редких метрических книгах можно найти разночтения.