Фамилия Рефиева — женская форма мужской фамилии Рефиев, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В русской ономастике такие фамилии обычно строятся по отчественной модели: основа + суффикс -ев (или -ов). Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Рефиев, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Рефий.

Самая вероятная версия возводит основу к личному имени или прозвищу Рефий. В русских говорах слово «рефий» могло быть искажением или диалектным вариантом имени Рафий (от древнееврейского Рафаэль — «Бог исцелил»). Такие имена, как Рафаил, Рафик, в просторечии часто укорачивали и переделывали: Рефий, Рефа. Соответственно, фамилия Рефиев — это «сын Рефия», а Рефиева — его дочь или жена.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза: связь с тюркским корнем «реф» или «раф» — «высокий», «возвышенный». В этом случае прозвище Рефий могло характеризовать рост или социальное положение человека. Однако для русской фамильной модели это менее типично: суффикс -ев обычно крепится к славянским или христианским именам, а не к прямым заимствованиям из тюркских языков.

Географически фамилия Рефиева встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, она возникла в среде крестьян или мещан центральной России или Поволжья, где были распространены имена из церковного календаря в народной переделке. Сословная принадлежность носителей не зафиксирована, но суффикс -ев без дворянской приставки указывает на непривилегированное происхождение — фамилия «сыновья», а не «княжеская».

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то ближайшие аналоги — Рефин, Рефьев, Рефанов. Все они редки и образованы от той же основы. В отличие от массовых Ивановых или Петровых, Рефиева сохраняет связь с конкретным, почти забытым именем, что делает её ценной для семейной истории: предок точно носил имя или прозвище Рефий, а не просто отчество от распространённого святца.