Фамилия Рожнатовская образована от названия населённого пункта с корнем «рожн-». В польской и западнорусской топонимике встречаются Рожнатово, Рожнатовка, Рожнатычи — все они восходят к слову «рожен» (рожон, рожна), которое в древности обозначало заострённый кол, шест, а в переносном смысле — «острый предмет», «рог» или «клин земли». Таким образом, предок мог получить фамилию по месту жительства: выходец из села, стоявшего на мысу, на остром изгибе реки или на месте, где когда-то ставили колья для ограды или охоты.

Суффикс «-овск-/-евск-» с окончанием «-ая» — типичная польско-шляхетская модель (как в фамилиях Жултовская, Ковалевская). В Речи Посполитой такие фамилии носили мелкие дворяне, владевшие одноимёнными усадьбами. После разделов Польши и присоединения западных земель к Российской империи часть носителей перешла в православие, а фамилия закрепилась в украинских и белорусских губерниях. Встречается также вариант Рожнатовский (мужская форма), который чаще фиксируется в метриках Волынской и Киевской губерний XIX века.

Редкость фамилии объясняется её узкой географической привязкой. Основной ареал — юго-восток Польши (Подкарпатское воеводство) и прилегающие районы Западной Украины. В отличие от массовых фамилий на «-ов», Рожнатовская не получила широкого распространения из-за того, что исходное село, скорее всего, было небольшим, а дворянский род — немногочисленным. Современные носители в России встречаются эпизодически, чаще всего как потомки переселенцев конца XIX — начала XX века.

Версия о происхождении от прозвища «Рожнатый» (человек с острым, колючим характером) менее вероятна: суффикс «-овск-» в русской традиции почти всегда указывает на территориальную, а не личную основу. Если бы фамилия была прозвищной, мы бы увидели форму Рожнатов или Рожнатович.