Фамилия Рубба — редкий случай, когда написание почти не оставляет сомнений в происхождении, но зато ставит вопросы о языке-источнике. В русской среде она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, а значит, перед нами либо позднее заимствование, либо фамилия, застывшая в первоначальной форме без русифицирующего суффикса.

Скорее всего, основа — прозвище или имя Рубба. В южнославянских языках, особенно в болгарском и сербском, слово «руб» означает «шрам» или «рубец». Прозвище Рубба могли дать человеку со следами на лице или теле от ран, ожогов или болезни. В пользу этой версии говорит то, что в тех же языках фамилии на -а нередко оставляют без изменений, не добавляя окончаний родительного падежа, как это делали в России. Если предки носителя фамилии переселились в Российскую империю с Балкан, например, во время русско-турецких войн или в ходе миграций XIX века, фамилия могла закрепиться именно в такой записи.

Другая, менее вероятная версия отсылает к немецкому языку. В немецком «Rube» или «Rubba» могло быть диалектным вариантом фамилии, образованной от личного имени Рубен (Ruben) или от слова «Rübe» — репа. В таком случае фамилия попала бы в Россию вместе с немецкими колонистами, которых в XVIII–XIX веках селили в Поволжье, на юге Украины и в Закавказье. Однако написание с двумя «б» (Rubba) встречается в немецких источниках реже, чем однобуквенное, поэтому балканский след выглядит надёжнее.

Фамилия Рубба не имеет отношения к русскому слову «рубить» или «рубль» — это внешнее звуковое совпадение. Её носители в России, скорее всего, потомки переселенцев, сохранивших память о прозвище предка. Географически фамилия встречается в Запорожской и Херсонской областях, что косвенно подтверждает связь с южнославянскими переселенцами, оседавших в Новороссии.