Фамилия Рунцова — женская форма фамилии Рунцов, и, чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с основой. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев обычно образуются от имён, прозвищ или профессий отца. Слово «рунец» или «рунц» — нечастое, но встречающееся в говорах. В северных и сибирских диалектах «рунец» могли называть человека с рыжеватыми, «русыми» волосами (от «руно» — шерсть, но в переносном смысле — цвет). Есть и другая версия: «рунц» — это вариант слова «рубец» или «рунец» в значении «шрам, складка на ткани», так могли прозвать портного или человека с заметным шрамом.

Словообразовательная модель проста: к прозвищу Рун (или Рунец) добавился патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Рунцов). Женская форма Рунцова закрепилась как фамилия жены или дочери. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, что типично для фамилий, образованных от прозвищ, а не от календарных имён.

Географически фамилия Рунцова тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается в архивах Вологодской, Архангельской и Костромской губерний, что косвенно подтверждает диалектную версию о «рунце» как о цвете волос — в этих краях «русый» и «рыжий» часто смешивались в народной речи. В отличие от фамилий Руньков или Рунов, где корень может быть связан с «руной» или «руиной», здесь основа более прозрачная и бытовая.

Споров о происхождении немного: версия с рыжиной или руном выглядит правдоподобнее, чем попытки связать фамилию с немецким «Rund» (круглый) — для центральной России такая этимология надуманна. Никаких знатных родов или громких исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что типично для массовой крестьянской фамилии: предки Рунцовых — скорее всего, ремесленники или землепашцы, получившие прозвище по внешней примете.