Фамилия Рутто — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает со звучанием, а происхождение упирается в географию. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин, Рутто имеет финаль -о, что сразу выдаёт в ней не великорусскую, а скорее западнославянскую или балтийскую основу. В польском, белорусском или литовском языках такие окончания — норма, и фамилия могла попасть в русскую среду через миграцию из бывшего Великого княжества Литовского.

Самая очевидная версия связывает Рутто с прозвищем или именем Рут, которое восходит к латинскому «ruta» — рута, растение. В средневековой Европе рута считалась символом горечи и раскаяния, но в бытовых прозвищах чаще просто указывала на человека, который выращивал или продавал эту траву. Фамилии Рут, Рута, Рутковский встречаются у поляков и белорусов, и Рутто — одна из их фонетических вариаций, где суффикс -о выполняет роль уменьшительного или патронимического окончания («сын Рута»).

Менее распространённая, но возможная версия — от немецкого «Ruth» (скорбь, сожаление) или от древнегерманского имени Hrodohaidis, которое дало начало именам Руди, Рут. В таком случае Рутто — это фамилия, занесённая в Российскую империю немецкими колонистами или прибалтийскими немцами. Прямых доказательств этой гипотезы для русской ономастики нет, но единичные носители фамилии действительно фиксируются в старых адрес-календарях Прибалтики.

В русских переписных книгах и ревизских сказках фамилия практически не встречается — это говорит о том, что её носители были либо немногочисленны, либо принадлежали к мещанскому или крестьянскому сословию западных губерний. В советское время Рутто могла обрусеть: ударение сместилось на первый слог, а написание закрепилось с двойным «т», хотя в польском языке чаще пишут «Ruto» или «Rutko». Если вы носите эту фамилию, скорее всего, ваши предки жили на границе с Польшей или Литвой и занимались земледелием или ремеслом, связанным с травами.