Фамилия Рюбен — редкая в русском контексте, и её происхождение неочевидно. Сразу скажем: русской по модели образования она не является. В русской традиции фамилии образуются с помощью суффиксов -ов/-ев, -ин, -ский, а здесь мы видим чистую основу, без типичного окончания. Это указывает на иноязычные корни, скорее всего, из западноевропейских языков, где фамилии часто оканчиваются на согласный, как в немецком, голландском или скандинавском.

Наиболее вероятная версия — происхождение от немецкого Ruben или нидерландского Ruben. В основе лежит библейское имя Рувим (Reuben) — старший сын Иакова. В немецкой традиции имя могло стать фамилией без изменений, как это часто бывало с библейскими именами в протестантских семьях. В России такая фамилия могла появиться через немцев-колонистов, которых приглашали в XVIII–XIX веках, или через еврейское население, где имя Рувин (Рувен) также переходило в фамилию. У евреев ашкеназского происхождения фамилия Рюбен (Ruben) встречается как вариант от имени Рувим, с характерной для идиша заменой «в» на «б».

Другая, менее распространённая версия — связь с французским словом ruban («лента»), но она слаба: во-первых, написание Ruben в других языках обычно не даёт такого значения, во-вторых, фамилия Рюбен почти не фиксируется во французской ономастике. Также есть вариант, что фамилия могла возникнуть от прозвища, связанного с тюркским словом «рүбен» (в значении «грубый», «неотёсанный»), но это уже гипотеза без серьёзной опоры в словарях.

Поскольку фамилия не имеет русского суффикса, она не подчиняется типичной для России схеме «прозвище + -ов». Носители фамилии Рюбен в России — это, скорее всего, потомки обрусевших немцев или евреев, сохранивших оригинальное написание. Встречается она крайне редко, и в дореволюционных метрических книгах её можно найти разве что в местах компактного проживания немецких колонистов (Поволжье, Новороссия) или в черте оседлости. Сословная принадлежность неопределима: фамилия могла быть и у крестьянина-колониста, и у городского ремесленника.