Фамилия Сакмаркин образована от названия реки Сакмары — правого притока Урала, протекающего по территории Башкортостана и Оренбургской области. В основе, скорее всего, лежит прозвище по месту жительства: Сакмаркой или Сакмарцем называли человека, который жил на берегу этой реки, пришел оттуда или промышлял на ней. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Сакмаркин, то есть сын Сакмарки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я.

Слово «Сакмар» имеет тюркские корни. По одной из версий, в основе башкирское «һаҡмар» — «осторожная река» или «река, текущая по степи». Другие исследователи связывают название с иранским «сак» (скиф) и «мар» (река), то есть «скифская река». В любом случае, фамилия напрямую связана с географией Южного Урала и Приуралья, где река Сакмара — заметный гидроним.

Сакмаркины — фамилия сравнительно редкая. Её география тяготеет к Оренбуржью, Башкортостану и соседним областям, что подтверждает топонимическое происхождение. Встречается также в Сибири, куда люди переселялись в ходе аграрных реформ или столыпинской миграции. В дореволюционных переписях носители фамилии фигурируют как крестьяне, казаки, реже мещане — типичные сословия для уральского пограничья.

Обратим внимание на суффикс. Если бы фамилия образовалась от полной формы «Сакмар» (без «-ка»), она звучала бы как Сакмаров. Вариант с -ин подсказывает, что в основе лежало именно прозвище на -ка: Сакмарка. Такое уменьшительно-оценочное прозвище могли дать человеку невысокого роста или с покладистым нравом, но первичное значение — всё равно река. Фамилия не имеет отношения к сакмам (военным походам) или сакмарам (виду обуви) — это народная этимология, которую поддерживать не стоит.