Фамилия Сакуто — редкая, и её происхождение почти наверняка не связано со славянской традицией. В русском языке нет корня «сакут-», а привычные суффиксы (-ов, -ин, -ский) здесь отсутствуют, что сразу указывает на иноязычную основу.

Скорее всего, фамилия Сакуто имеет японские корни. В японском языке фамилии часто образуются от географических названий или природных явлений. «Сакуто» (佐久藤 или 作人) может означать «цветущий глициния» или «создающий человека», но самый прямой вариант — запись иероглифами 佐久東, где «саку» (佐久) — часть топонима (например, город Саку в префектуре Нагано), а «то» (東) — «восток». Получается «восток Саку» или «восточный Саку». В Японии фамилия существует, но не входит в число распространённых.

Вторая версия — итальянская. В итальянском языке слово «sacco» означает «мешок», а суффикс «-uto» часто образует прилагательные со значением «обладающий чем-то» (например, «barbuto» — бородатый). «Sacuto» теоретически могло бы значить «мешковатый» или «тот, кто носит мешок», но это маловероятно: в итальянских фамилиях такая модель редка, и в исторических записях она почти не встречается.

Третья гипотеза — искусственное происхождение. В советское время при паспортизации народов Севера или Дальнего Востока чиновники могли записать фамилию на слух, исказив местное имя или прозвище. Например, у нивхов или эвенков есть личные имена, похожие на «Сакуто», которые при адаптации превратились в фамилию.

Если ваши предки — из Японии, фамилия, скорее всего, связана с местностью или природой. Если из России — это почти наверняка позднее заимствование или случайная запись. Точных данных о сословии или географии бытования фамилии Сакуто в открытых источниках нет, что подтверждает её исключительную редкость.