Фамилия Самракин — одна из тех, где корень не лежит на поверхности, и сразу бросается в глаза необычное сочетание звуков. В отличие от фамилий на «-ов» и «-ин», образованных от крестильных имён, здесь основа явно нецерковная, что указывает на прозвищное происхождение.

Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «самрак» или «самра». В ряде тюркских языков «самрак» означает «мелкий, частый, густой» (например, о лесе или кустарнике). Прозвище Самрак могли дать человеку с густыми волосами или бровями, либо тому, кто жил в густых зарослях. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — сын Самрака, то есть потомок человека с таким прозвищем.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с древним личным именем Самра, которое могло быть производным от арабского «самар» (беседа, ночное собрание) или же от тюркского «сам» (шаман, колдун) с добавлением уменьшительного «-ра». Однако эта гипотеза слабее, так как имя Самра не зафиксировано в древнерусских святцах и редко встречается в исторических документах.

Географически фамилия Самракин тяготеет к регионам, где издавна было сильное тюркское влияние: Поволжье (Татарстан, Башкортостан), южный Урал, а также к казачьим областям. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальный характер. Носители фамилии — это, вероятно, потомки русских или крещёных татар, получивших прозвище от соседей-тюрков или перенявших бытовое слово.

С точки зрения словообразования, фамилия Самракин — типичный пример «чистого» патронима, где к основе сразу прирос суффикс «-ин», минуя промежуточные формы на «-ов». Это делает её более древней по модели, чем фамилии вроде Самраков, которые образовывались позже и по другому принципу. Таким образом, предки Самракиных, скорее всего, были вольными людьми, жившими на окраинах государства, где смешивались языки и культуры.