Фамилия Самаракина — женская форма фамилии Самаракин, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Самарака. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Самаракин — «сын Самараки» или «человек из рода Самараки». Суффикс -ак- в основе (Самар-ак-а) характерен для русских прозвищ и уменьшительных имён, часто с оттенком фамильярности или ласкательности.

Корень «Самар-» в русской ономастике многозначен. Самое очевидное — связь с названием города Самара. Прозвище Самарака могли дать человеку, пришедшему с берегов Волги, из одноимённого региона. Однако не менее вероятна версия, что корень восходит к тюркским языкам: «самар» в ряде тюркских диалектов означает «мешок», «кожаный бурдюк» или «вьюк». Прозвище Самарака в таком случае могло относиться к человеку, который шил мешки, торговал ими или имел какую-то особенность внешности (например, сутулость, напоминающую мешок за спиной). В словаре В. Даля зафиксировано слово «самара» в значении «долгая одежда, балахон», что тоже могло стать источником прозвища для носителя длиннополой одежды.

С географической точки зрения фамилия Самаракина — редкая. Она не входит в число распространённых русских фамилий и не имеет ярко выраженной гнездовой концентрации, хотя логично предположить её бытование в Поволжье, Самарской области и прилегающих регионах. Встречаемость фамилии в исторических документах невысока, что говорит о её относительно позднем закреплении или локальном характере.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Самарин, Самарцев, Самарский) показывает, что Самаракин стоит особняком: если Самарин чаще всего выводят от имени Самара (сокращённое от Самуил или Самарий), а Самарский — явно топонимическая фамилия, то Самаракин с суффиксом -ак- выдаёт скорее прозвищное, бытовое происхождение. Вероятнее всего, предок носительницы этой фамилии получил уличное прозвище Самарака — не по имени и не по городу, а по какой-то житейской черте, ремеслу или внешности.