Фамилия Самаракин — нечастая, но её происхождение угадывается довольно уверенно. В её основе лежит либо географическое название, либо прозвище, и обе версии ведут в одно и то же смысловое поле.

Первый и самый логичный путь — от названия реки Самара. Сейчас это Волга, но в древности так называли её левый приток, а также существовал гидроним «Самара» в бассейне Днепра. Если предок получил прозвище Самарака или Самара, это могло указывать на человека, пришедшего с берегов этой реки. Суффикс -ин в фамилии Самаракин работает по той же модели, что и в фамилиях Москвин, Тверитин или Волгин: он указывает на принадлежность к местности («чей?» — «сын человека с Самары»).

Вторая версия — от прозвища, связанного с диалектным словом «самара». В южнорусских и украинских говорах так называли длинную крестьянскую одежду, нечто вроде свиты или армяка. Тогда Самарака — это человек, носивший такую одежду, либо портной, который её шил. В пользу этой версии говорит то, что прозвища по одежде в русской ономастике очень распространены, а фамилии на -акин, -аков часто образовывались именно от таких бытовых слов.

Модель образования проста: основа «Самарак-» (от имени или прозвища Самарака) плюс типичный русский суффикс -ин, обозначающий «сын такого-то». Фамилия не дворянская и не книжная — она из крестьянской или посадской среды. Встречается она в основном в Поволжье, что косвенно подтверждает первую, «речную» версию: носители фамилии могли расселяться от Самарской луки. Однокоренные фамилии — Самарин, Самарский, Самаров — гораздо частотнее, а Самаракин остаётся более редким вариантом, в котором сохранилась уменьшительная или прозвищная форма.