Фамилия Санашкина образована от мужского имени или прозвища Санашка. Это разговорная, уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Александр или, реже, от имени Савва. В русской традиции имена с суффиксом -шк- (-шка) часто приобретали фамильярный или просторечный оттенок: Санашка, Минашка, Ванюшка. Такие формы бытовали в крестьянской и мещанской среде, где полное церковное имя в быту заменяли более короткими и привычными вариантами.

В основе фамилии лежит не столько само имя, сколько его народная переделка. Александр в просторечии давал множество производных: Саня, Саша, Шура, а также Санька, Санашка. Последняя форма характерна для говоров, где аканье и смягчение согласных приводили к появлению варианта «Санашка» вместо «Санька». Фамилия Санашкин (женская форма Санашкина) закрепилась, когда отца или главу семьи в документах записали как Санашку — так его называли в деревне.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Санашкин, то есть сын, потомок Санашки. Модель образования типична для русских фамилий, возникших в XVI–XVII веках в среде служилых людей, крестьян и посадских. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от прозвищ с конечным -о или твердым согласным, фамилии на -ин шли от имен и прозвищ на -а/-я. Географически фамилия Санашкина встречается в центральных областях России, особенно в бывшей Рязанской, Тамбовской и Нижегородской губерниях, где акающие говоры были нормой.

Сам корень «Сан-» восходит к греческому Александр (защитник людей), но через цепочку народных сокращений имя утратило книжное звучание и стало бытовым прозвищем. В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна) подобные фамилии относят к разряду «полуименных» — они стоят на грани между крестильным именем и уличным прозвищем. Санашкины, скорее всего, были потомками крестьянина или ремесленника, которого в округе знали не по полному имени, а по домашнему, ласковому прозвищу — Санашка.