Фамилия Сабашкина происходит от прозвища Сабашка, которое давали родоначальнику. Спор о происхождении этого прозвища сводится к трем основным версиям, и ни одну из них нельзя отбросить без оговорок.

Наиболее вероятной выглядит связь с этнонимом Сабаш — так называлось одно из родовых подразделений древних башкир. В этом случае прозвище Сабашка указывало на принадлежность предка к конкретному роду, что было обычной практикой при формировании фамилий у народов, где родоплеменная структура сохранялась долго. Позже, при русификации, к основе добавился типичный русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность: Сабашкин — сын Сабашки.

Слабее выглядит версия, выводящая прозвище из киргизского слова «сабаш» — «устраивать потасовку». Если принять её, то основатель рода получил имя за любовь к кулачным боям и дракам. Такое объяснение правдоподобно для прозвищ, но менее убедительно, поскольку не объясняет, почему именно киргизское слово попало в русскую среду.

Третья версия связывает прозвище с украинским словом «сабаш» — то есть «шабаш». Шабаш, слово древнееврейского происхождения, означало «покой». У славян так называли субботу, день отдыха и молитвы, когда заканчивали работу. Тогда прозвище Сабашка могло характеризовать человека, который любил отдыхать и неохотно брался за труд. Эта версия тоже имеет право на существование, хотя и не подкреплена столь же очевидной региональной привязкой, как башкирская.

Сама фамилия Сабашкина — форма женского рода, мужской вариант — Сабашкин. По модели образования она типична для восточнославянских фамилий: основа прозвища плюс притяжательный суффикс -ин. Такие фамилии закреплялись за потомками человека, которого звали Сабашка, и передавались из поколения в поколение.