Фамилия Санаянць стоит особняком среди русских фамилий хотя бы из‑за своего окончания. Суффикс -янц (или -янць в старой орфографии) — яркий маркер армянского происхождения, причём не просто армянского, а конкретно западного диалекта. В восточноармянском языке (литературном, на котором говорят в Республике Армения) патронимический суффикс выглядит как -ян: Геворкян, Саркисян. А вот -янц — это форма родительного падежа множественного числа, которая в фамилиях закрепилась у армян, живших в Османской империи, а позже — у их потомков, переселившихся в Российскую империю, на Кубань, в Ростовскую область и в Крым. Сочетание -янц в русской записи нередко превращалось в -янц, а при советской паспортизации могло упроститься до -янц или -янцев, но исходный вариант Санаянць (с мягким знаком на конце) — это как раз дореволюционная, «старая» передача.

Основа фамилии — Сана. Это может быть как армянское личное имя Сана (возможно, от «сана» — «тонкий, изящный» или «святой»), так и прозвище. В армянской ономастике встречается имя Сананян, образованное от имени Санан — сокращённой формы от Санджах, но здесь мы видим именно Санаянць, то есть «из рода Саная» или «принадлежащий Санаю». Имя Санай или Саная — скорее всего, уменьшительно-ласкательная форма от более полного имени, например, от Санасара или Санасара (в армянском эпосе есть герой Санасар).

Таким образом, носитель фамилии Санаянць — это потомок человека по имени Сана (или Саная). Поскольку суффикс -янц указывает на принадлежность к роду, предок мог быть уважаемым членом общины, возможно, ремесленником или торговцем, но точных сведений о его сословии нет. Географически фамилия тяготеет к югу России, где осели армянские переселенцы из Западной Армении, — это Краснодарский край, Ставрополье, Ростовская область. Встречается она редко, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: каждый носитель Санаянць, скорее всего, связан с небольшой, но чётко очерченной ветвью армянской диаспоры.