Фамилия Санготра — редкая и не сразу поддающаяся разбору. В русской ономастике её обычно связывают с греческим происхождением, что сразу выделяет её на фоне типичных славянских фамилий. Основа «Санготра» скорее всего восходит к греческому слову «санготари» — так в некоторых диалектах называли тростник, камыш или заросли у воды. В таком случае фамилия могла быть прозвищем человека, жившего у болотистой местности или занимавшегося плетением из камыша.

Модель образования здесь необычна для русского уха. В греческом языке фамилии нередко заканчиваются на -ас, -ис, -ос, но форма Санготра — это, по сути, чистая основа без суффикса. Она попала в русскую среду через переселенцев, вероятно, из числа греков Приазовья или Крыма. В XIX веке многие греки переселялись на юг Российской империи, и их фамилии русифицировались лишь отчасти — окончание осталось без изменений, что для русского языка редкость.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же «голых» основ, как, скажем, Кандиба или Саламаха. Суффикс -а здесь не является типичным русским фамильным суффиксом (как -ов или -ин), а служит окончанием греческого женского рода, которое закрепилось и за мужчинами. Это указывает на то, что фамилия не прошла полную русификацию и сохранила свою первоначальную форму.

Встречается Санготра и в некоторых документах XIX века среди греческих общин Мариуполя и Таганрога. Вторая, менее распространённая версия, связывает её с итальянским диалектным словом «sangotra» — якобы так называли торговца кровью (от «sangue» — кровь). Но эта гипотеза слабая: никаких следов массового итальянского влияния на юге России в те времена не зафиксировано, а греческая версия подкреплена и географией, и историей переселений.

Таким образом, предки носителя фамилии Санготра с высокой вероятностью были греческими переселенцами, возможно, связанными с ремёслами у воды или жившими в камышовых низинах. Фамилия не получила широкого распространения, но её необычная форма — ценный след миграционных процессов на юге России.