Фамилия Санжакова — женская форма фамилии Санжаков, и её происхождение напрямую связано с тюркским миром. В основе лежит слово «санжак» (sancak), которое в османской и более широкой тюркской традиции означало «знамя», «стяг» или «флаг». В Османской империи санджаком называли административную единицу, провинцию, которой управлял санджак-бей, и символом его власти как раз было знамя. Таким образом, прозвище Санжак могли дать воину-знаменосцу или человеку, имевшему отношение к военной или административной службе — например, сборщику податей или начальнику стражи.

Модель образования фамилии стандартна для русского языка: тюркское прозвище Санжак + патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Санжака»). Женская форма Санжакова закрепилась за женой или дочерью носителя фамилии. Важно, что фамилия не имеет отношения к санскриту или индийским именам, как иногда ошибочно предполагают из-за созвучия: её корни — в тюркской ономастике Поволжья, Приуралья или Сибири.

Географически фамилия Санжаковы встречается в основном среди татар, башкир и чувашей, а также у русских, живущих в зоне давних тюркских контактов. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались в Казанской, Оренбургской и Уфимской губерниях. Интересная деталь: в некоторых говорах «санжак» могло означать не только знамя, но и «кнут» или «плеть» (от тюркского «санжа» — бить, сечь). В таком случае прозвище мог получить строгий или вспыльчивый человек, но эта версия менее распространена, чем «знамённая».

С точки зрения социального статуса, предки Санжаковых скорее всего были служилыми людьми — казаками, стрельцами, толмачами, которые несли пограничную или административную службу на юго-восточных рубежах России. Фамилия не относится к дворянским, но и не крестьянская в узком смысле: её носители входили в сословие «служилых инородцев» или государственных крестьян. Современные носители фамилии живут в Татарстане, Башкортостане, Челябинской области, а также в Москве и Санкт-Петербурге.