Фамилия Сайбурхонова — редкий пример фамилии, образованной от сложного тюркско-персидского имени. Её основа, имя Сайбурхон, состоит из двух частей: «сай» (с тюркских языков — «обильный», «щедрый» или «почтенный») и «бурхон» (от персидского «борхан» — «доказательство», «довод», а в исламской традиции — одно из имён пророка Мухаммеда). В целом имя означает «щедрый как доказательство» или «почтенный довод», что звучит как религиозно-философская характеристика, типичная для мусульманских имён. Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: Сайбурхонова — «дочь (или жена) Сайбурхона».

Фамилия явно восходит к мужскому личному имени Сайбурхон, которое было распространено среди народов Средней Азии, особенно в Узбекистане и Таджикистане. В русской среде такие фамилии встречаются крайне редко, и их носители — почти всегда потомки переселенцев из этих регионов. Интересно, что фамилия не прошла через типичную русификацию (например, не превратилась в Сайбурхонов с ударением на первый слог), а сохранила исходное звучание с ударением на последний слог — Сайбурхонова.

Словообразовательная модель здесь необычна: в отличие от большинства русских фамилий на «-ов», которые образуются от прозвищ или профессий, Сайбурхонова напрямую происходит от полного мусульманского имени. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был, скорее всего, уважаемым человеком в своей общине — возможно, религиозным деятелем или старейшиной, чьё имя не сокращали до бытового прозвища. В русских документах XIX — начала XX века такие фамилии фиксировались у выходцев из Туркестанского края, где имя Сайбурхон встречалось среди оседлого населения.

Географически фамилия привязана к Ферганской долине и окрестностям Самарканда. В современной России она редка, но встречается в Татарстане и Башкортостане — вероятно, через смешанные браки или миграции. Других версий происхождения (например, от тюркского «сай» — «каменистое русло реки») нет: корень «бурхон» однозначно указывает на персидское заимствование, а не на местную географию.