Фамилия Секирчин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с конкретным орудием. Корень «секир-» восходит к слову «секира» — старинному рубящему инструменту, боевому топору. Однако обладатель такого прозвища вряд ли был воином с секирой наперевес. Скорее всего, прозвище Секира дали человеку с грубым, резким характером, либо тому, кто работал с топором — леснику, плотнику, дровосеку. В русских говорах слово «секира» могло означать и просто большой тяжёлый топор, поэтому прозвище закреплялось за мастеровыми людьми.

Суффикс «-ин» указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ и названий профессий, оканчивающихся на -а/-я: Секира → Секирчин. Буква «ч» перед суффиксом — результат чередования к/ч (как в парах «рука — ручка»), что говорит о древности формы. В отличие от фамилий на «-ов» (Секеров), вариант с «-ин» встречается реже и часто указывает на северные или центральные регионы России.

Географически фамилия встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда. По данным переписей XIX века, Секирчины записаны в Вологодской, Костромской и Вятской губерниях — в зоне плотного лесного хозяйства, где топор был главным орудием крестьянина. В некоторых случаях фамилия могла возникнуть и от мирского имени Секира, которое родители давали ребёнку как оберег от злых сил — считалось, что «рубящее» имя отсекает болезни и беды.

Среди однокоренных фамилий — Секирин, Секиров, Секирёв. Форма Секирчин стоит особняком: у неё более архаичный облик, и она почти не встречается за пределами русского Севера. В современной России фамилия малочисленна, что делает её ценной для генеалогического поиска — потомки, скорее всего, сохранили связь с конкретной местностью.