Фамилия Семеклит — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение, скорее всего, не связано с русским языком напрямую. В русской ономастике нет корня «семекл-», а суффикс -ит нехарактерен для исконных русских фамилий (обычны -ов, -ев, -ин, -ский). Это сразу подсказывает, что перед нами фамилия-«иностранец», которую переделали на русский лад или записали на слух.

Наиболее вероятная версия ведёт к греческому языку. Греческая фамилия Σεμεκλίδης (Семеклидис) или Σεμέκλης (Семеклис) могла быть русифицирована при переселении носителей в Российскую империю, в частности, в среду греков Приазовья или Крыма. Окончание -ит в таком случае — это адаптация греческого -ίδης («сын такого-то») или просто упрощение сложного для русского произношения окончания. Основа «Семекл-» может восходить к греческому слову σεμέκλι (семекли) — так в некоторых диалектах называли род пшеницы или особый сорт хлеба, но это лишь предположение, так как слово редкое и словарно не зафиксировано.

Вторая, менее вероятная версия — искусственное происхождение. В XIX веке в духовных семинариях иногда давали фамилии из церковнославянских или греческих корней. Семеклит могло быть образовано от греческого σημεῖον (семион — «знак, знамение») с добавлением -клит (от κλητός — «званный»), что в сумме могло означать «званный знаком» или «призванный знамением». Однако такая конструкция выглядит надуманной, и в реальных семинарских списках эта фамилия не встречается.

Географически фамилия Семеклит сегодня встречается единично, в основном на юге России и в Украине, что косвенно подтверждает греческую гипотезу: именно в тех регионах исторически селились греческие переселенцы. Если ваши предки носили эту фамилию, они почти наверняка были выходцами из греческой диаспоры, возможно, торговцами, хлеборобами или священнослужителями, получившими фамилию при записи в метрические книги.