Фамилия Семекова — женская форма, а её мужской вариант — Семеков. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение напрямую связано с тюркскими языками, скорее всего, с казахским, башкирским или татарским. Основа фамилии — личное имя Семек или Семекей, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «семек» (в разных диалектах — «семь», «семеро» или «сильный», «могучий»). В древнетюркской антропонимии числительные часто становились именами-оберегами: назвать сына Семеком — значит пожелать ему долгой жизни, силы и многочисленного потомства.

Суффикс -ов (-ев) типичен для русской модели образования фамилий, но в данном случае он «наложился» на тюркскую основу. Это результат многовекового взаимодействия культур: в XIX–XX веках русская администрация активно оформляла фамилии народов Поволжья, Урала, Казахстана и Средней Азии по своему образцу. Так Семек превратился в Семекова. Важно, что фамилия не имеет отношения к русскому слову «семечки» или к чему-либо похожему — это чисто тюркский след.

География фамилии сегодня сосредоточена в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, а также в Казахстане. Встречается и у казахов, и у башкир, и у татар — что неудивительно, ведь имя Семек было распространено у всех этих народов. Интересно, что в некоторых диалектах башкирского языка «семек» означает «крепкий, здоровый, коренастый» — возможно, прозвище давали человеку с такой внешностью.

С точки зрения социального контекста, предки носителей фамилии Семекова, скорее всего, были скотоводами или земледельцами. Судя по отсутствию фамилии в дворянских родословных книгах, это крестьянский или казачий род. Дворянство в Российской империи редко получали тюркские роды, а если и получали, то фамилии обычно закреплялись в форме с суффиксом -ин, а не -ов.

Версия о том, что Семекова может быть образована от прозвища Семека (от «семенить», «суетиться»), маловероятна: такая модель нехарактерна для тюркских языков, а сама фамилия не встречается в центральных русских регионах, где бытовали подобные говоры. Так что основная и наиболее обоснованная гипотеза — тюркское имя-числительное или прозвище по качеству.